病原菌丝洁白、绢丝状，从中心向四周辐射状扩展。菌丝有横隔，分枝常呈直角，分枝基部略缢缩。 菌核大多圆形，直径为0.9～1.3mm。2～3个或多个菌核能互相联接在一起。菌核表生，球形或椭圆形，平滑而有光泽如油菜籽，由白色变黄褐色。内部白色，构成细胞多角形，表面的细胞色深而小。菌核萌发时其周围长出辐射状白色菌丝体。 病原菌在自然条件下不易产生担子。

丹参感病后从近地面的根茎处开始发病，逐渐向地上部和地下部蔓延。病部皮层呈水渍状变褐坏死，最后腐烂，其上出现一层白色绢丝状菌丝层，呈放射状蔓延，常蔓延至病部附近土面上；发病中后期，在白色菌丝层中形成黄褐色油菜籽大小的菌核。严重时腐烂成乱麻状，最终导致叶片枯萎，全株死亡。