分生孢子盘散生，初埋生在寄生表皮下，后外露，暗褐色，卵圆形，分生孢子盘上具有长而硬的深褐色刚毛，刚毛常稍弯，1～2分隔，大小193～207μm。 分生孢子梗，单胞，无色，棍棒形，顶端钝圆或稍尖，不分枝，集生于分生孢子盘内，顶生分生孢子，大小4.8～14.7μm×2.5～4.9μm，有时长达20μm。 分生孢子长椭圆形，单胞，无色，内含油球1～2个，大小8μm～13μm×4.5μm～5μm。聚集成团呈橘红色。 果炭疽病的分生孢子盘刚毛少，叶炭疽病的分生孢子盘刚毛多。 在琼脂培养基上后期能生刚毛。

枸杞炭疽病又称黑果病，主要为害果实，也可侵染嫩枝、叶和花。青果发病初期，果面出现针头大的褐色小圆点，后扩大呈不规则形病斑；后病斑凹陷、变软，果实整个或部分变黑。干燥时果实干缩，病斑表面长出近轮纹状排列的小黑点，为病菌的分生孢子盘。