枣疯病植原体的大小因存在部位不同而有所差异，在感染枣疯病的新梢韧皮薄壁细胞的超薄切片中，植原体的直径一般为150～620nm，在病叶叶脉筛管中直径为80～970nm，厚度为10nm，界膜清楚。

枣疯病的典型症状主要表现为花变叶、芽的不正常萌发、丛枝、根部病变和果的畸形等。病枝节间变短、纤细，小叶黄化或叶片凹凸不平，呈不规则的块状，黄绿不均，叶色较淡，入秋后干枯，不易脱落。病株花器退化表现为花柄、花萼、花瓣、雄蕊伸长为小枝，顶端长1～3片小叶，使结果枝变成细小密集的丛生枝。病株上一般很少结果，即使结果，果实一般着色浅，组织松散、糖分低，果实品质差。病株根部症状表现为根瘤，根上的不定芽可大量萌发长出一丛丛短疯枝，出土后枝叶细小、黄绿，日晒后全部焦枯呈“刷状”。后期病根皮层变褐腐烂，最后整株枯死。